区分两个孕囊是同卵还是异卵的方法如下：
1.超声检查：通过超声检查可以观察孕囊的形态、大小、数量等特征。同卵双胞胎的孕囊通常形状相似，大小也相近；而异卵双胞胎的孕囊则可能形状不同，大小也有差异。
2.基因检测：如果孕囊已经发育到一定阶段，可以通过基因检测来确定它们是否来自同一个受精卵。同卵双胞胎的基因是完全相同的，而异卵双胞胎的基因则只有50%相同。
3.孕囊位置：同卵双胞胎的孕囊通常位于子宫的同一部位，而异卵双胞胎的孕囊则可能位于不同的部位。
需要注意的是，以上方法并不能百分之百地确定孕囊是同卵还是异卵，最终的诊断需要由专业的医生根据临床症状、超声检查和基因检测等结果综合判断。如果对孕囊的情况存在疑虑，建议及时咨询医生，以便做出正确的处理。