睫毛根部长透明水泡，可能是以下原因引起：
1.麦粒肿：睫毛根部的皮脂腺或睑板腺感染引起的急性化脓性炎症，可出现红色硬结，伴有疼痛，数天后可形成黄色脓点。
2.霰粒肿：睑板腺特发性无菌性慢性肉芽肿性炎症，可逐渐长大，无明显疼痛，病变处皮肤隆起。
3.眼部过敏：接触过敏原后，可出现眼部瘙痒、红肿，有时可表现为睫毛根部的透明水泡。
4.病毒感染：单纯疱疹病毒感染可引起唇部及周围皮肤出现水疱，有时可累及眼部，导致睫毛根部出现透明水疱。
5.其他：如寄生虫感染、药物过敏等也可引起类似症状。
如果发现睫毛根部长透明水泡，建议及时就医，明确诊断。在医生的指导下进行治疗。同时，要注意眼部卫生，避免揉眼，避免使用刺激性化妆品，避免长时间用眼。对于儿童和老年人，以及免疫力低下的人群，更应重视眼部症状，及时就医。