如果塞牙齿里的棉花发臭了，我们可以采取以下措施进行处理。
1.及时取出：首先，尽快用牙签或其他工具将棉花取出，避免臭味进一步扩散。
2.漱口清洁：用清水漱口，清除口腔中的残渣和异味。
3.避免再次使用：不要再将发臭的棉花放回牙齿间隙，以免引起更严重的问题。
4.就医处理：如果棉花引起了牙龈肿痛、出血等不适症状，或者你对处理方法不确定，最好咨询牙医的建议。他们可以根据具体情况提供更专业的处理方法。
需要注意的是，在使用棉花等物品填充牙齿间隙时，应遵循牙医的指导，并注意保持口腔卫生，定期洗牙和检查口腔健康。