上眼皮内长透明小水泡，可能是以下原因引起：
1.粟丘疹
粟丘疹是起源于表皮或附属器上皮的潴留性囊肿，可发生于任何年龄、性别，也可发生于身体任何部位。通常为白色或黄白色坚实丘疹，顶尖圆，上覆以极薄的表皮。可发生于原发性皮损上，也可出现在炎症性皮损之后。一般无自觉症状，通常不需治疗。如果影响美观，可在医生指导下，使用７５％酒精消毒后，用针挑破丘疹表面的皮肤，再挑出白色颗粒即可。
2.汗管瘤
汗管瘤是一种附属器肿瘤，本病女性多见，青春期发病或加重。部分患者有家族史。汗管瘤好发于眼睑及颊部，以硬韧的小丘疹为主要表现，很少自行消退，但不恶变。一般无需治疗，必要时可采用电解、电灼、冷冻或激光治疗。
3.结膜淋巴管扩张
结膜淋巴管扩张是一种原因不明的良性病变，表现为上睑结膜出现半透明小水疱，部分可自行吸收，也可破溃后形成肉芽肿。一般无需治疗，如果影响外观或反复出现，可考虑手术切除。
4.其他
此外，上眼皮内长透明小水泡还可能与药物过敏、蚊虫叮咬、病毒感染等有关。
如果发现上眼皮内长透明小水泡，建议及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意眼部卫生，避免揉眼，避免过度用眼。