怀孕40天进行流产对身体可能会有一定的伤害，但具体影响因人而异。以下是一些可能的伤害：
1.出血：流产可能会导致子宫内残留组织，需要进行清宫手术，这可能会引起出血。
2.感染：流产过程中，细菌可能会进入子宫，引起感染。
3.月经失调：流产可能会影响卵巢功能，导致月经失调。
4.子宫内膜损伤：流产可能会对子宫内膜造成损伤，导致习惯性流产或不孕症。
5.心理影响：流产可能会给女性带来心理创伤，如焦虑、抑郁等。
需要注意的是，以上只是一些可能的伤害，并不是每个人都会遇到。如果女性怀孕40天需要进行流产，应该选择正规的医疗机构，并在医生的指导下进行。同时，女性在流产后也需要注意休息，避免劳累和感染，注意个人卫生，保持心情愉悦。如果出现异常情况，如出血过多、发热、腹痛等，应该及时就医。