怀孕40天自然流产对身体伤害通常较小。以下是具体分析：
一、原因方面。怀孕40天自然流产可能源于胚胎发育期间胚胎发育不良，也可能和母体因素存在一定关联。
1.胚胎因素：在胚胎发育过程中，如果自身存在染色体异常等问题，就可能导致发育不良而自然流产。
2.母体因素：比如母体患有某些疾病，像严重的感染、内分泌失调、子宫畸形等，或者母体在孕期接触了有害物质、受到剧烈刺激等，都可能引发自然流产。
二、影响方面。此时胎儿较小，自然流产一般不会对女性身体造成太大影响，做好日常护理保健工作即可。
三、后续处理方面。流产后要关注宫腔内妊娠组织是否完全排净，若已彻底排净，通常无需过多治疗；若有残留，可在医生指导下使用新生化颗粒等药物来促进恶露排出，若不及时治疗，可能会导致宫腔感染。
四、注意事项方面。出现自然流产后需留意身体症状，一旦有异常情况，应尽快就医并积极配合医生治疗。
总之，怀孕40天自然流产后要做好各方面的观察和处理，以保障身体恢复良好。