根充后咬合疼痛可能由以下原因引起：
1.根尖周炎：根管治疗不彻底，导致根尖周炎复发，会出现咬合痛。此外，还可能伴有牙龈肿胀、牙齿松动等症状。
2.牙根纵裂：根管治疗后，牙根纵裂也会引起咬合痛。通常还会伴有牙齿变长、咀嚼无力等症状。
3.充填物过高：根管充填后，充填物过高，咬合时会使患牙早接触，导致咬合痛。
4.其他：如果根管治疗过程中损伤了邻牙，或术后感染等，也可能导致咬合痛。
如果根管治疗后出现咬合痛，建议及时就医，医生会根据具体情况进行诊断和治疗。如果是根尖周炎或牙根纵裂，可能需要重新进行根管治疗或拔牙；如果是充填物过高，需要磨除部分充填物；如果是其他原因引起的，需要进行相应的处理。
在等待就医期间，应避免用患侧咀嚼食物，以免加重疼痛。同时，可以口服一些止痛药缓解症状，但应按照医生的建议使用。