大便肛门疼痛的原因及治疗方法如下：
1.肛裂：
病因：肛裂是肛管皮肤全层纵行裂开所形成的小溃疡，常发生在肛门后位或前位。
病因导致症状的原理：肛裂的形成与多种因素有关，常见的原因包括肛管狭窄、便秘、感染等。肛裂发生后，肛门括约肌会痉挛收缩，导致疼痛加重。
治疗方法：急性或初发的肛裂可以通过增加膳食纤维食物，改变不良的大便习惯，温水坐浴，外用药物（如硝酸甘油软膏）等治疗。慢性肛裂可采用肛裂切除术等手术治疗。
2.外痔：
病因：外痔是齿状线以下的痔外静脉丛扩大曲张所形成的柔软静脉团。
病因导致症状的原理：外痔位于齿状线以下，受脊神经支配，痛觉敏感，一旦发生炎症、水肿或血栓形成，可出现肛门疼痛。
治疗方法：无症状的外痔无需治疗，有症状的外痔可以通过调整饮食、纠正便秘、坐浴等方法缓解，也可以外用痔疮膏、栓剂等药物治疗。保守治疗无效或痔脱出严重时，可考虑手术治疗。
3.肛管直肠周围脓肿：
病因：肛管直肠周围脓肿是指肛管直肠周围软组织或周围间隙发生的急性化脓性感染，并形成脓肿。
病因导致症状的原理：感染可导致肛管直肠周围组织出现炎症、水肿，甚至形成脓肿，从而引起肛门疼痛。脓肿形成后，疼痛会更加剧烈，并伴有发热、寒战等全身症状。
治疗方法：肛管直肠周围脓肿一旦形成，应及时切开引流，排出脓液。同时，使用抗生素控制感染。
4.肛窦炎：
病因：肛窦炎是指肛窦发生的炎症，多由细菌感染引起。
病因导致症状的原理：肛窦开口向上，容易积存粪便残渣和细菌，感染后可引起肛窦炎。炎症刺激可导致肛门疼痛，还可能伴有肛门下坠感、排便不尽等症状。
治疗方法：肛窦炎的治疗主要是药物治疗，包括外用栓剂、口服抗生素等。同时，应注意保持肛门清洁，避免便秘。
5.其他：
肛门癌：肛门癌也可导致肛门疼痛，还可能伴有大便带血、肛门瘙痒等症状。
肛管直肠癌：肛管直肠癌发展到一定阶段时，也可引起肛门疼痛。
肛门损伤：肛门受到外伤、烫伤、冻伤等损伤时，可出现疼痛。
其他：直肠炎、肛乳头炎等疾病也可能引起肛门疼痛。
总之，大便肛门疼痛的原因较多，可能是肛裂、外痔、肛管直肠周围脓肿等肛肠疾病引起，也可能是肛管直肠癌、肛门损伤等其他疾病导致。如果出现大便肛门疼痛，应及时就医，明确诊断后进行针对性治疗。