五个月宝宝睡觉摇头可能是正常的，也可能是由疾病引起的。以下是一些可能的原因：
1.正常的生理现象：
宝宝的神经系统尚未完全发育成熟，可能会出现一些无意识的动作，包括摇头。
宝宝的头皮可能会因为出汗、湿疹等原因而感到不适，摇头可以帮助缓解这种不适。
2.环境因素：
宝宝睡觉时所处的环境温度过高或过低，或者周围环境嘈杂，都可能影响宝宝的睡眠质量，导致摇头。
宝宝的床上用品可能过于厚重或不透气，也会让宝宝感到不舒服。
3.维生素D缺乏：
维生素D缺乏会导致宝宝钙吸收不良，进而引起神经兴奋性增高，出现多汗、摇头等症状。
宝宝如果长期晒太阳不足，也可能导致维生素D缺乏。
4.湿疹：
宝宝头皮上如果有湿疹，会导致瘙痒，从而引起摇头。
湿疹还可能伴有皮肤发红、脱屑等症状。
5.中耳炎：
中耳炎是儿童常见的疾病之一，如果宝宝患有中耳炎，可能会因为耳部疼痛而摇头。
中耳炎还可能伴有发热、哭闹等症状。
需要注意的是，如果宝宝摇头的同时伴有其他异常表现，如哭闹、烦躁、睡眠不安、夜惊等，或者摇头的症状持续时间较长，或者伴有其他身体不适，如皮疹、发热等，应及时带宝宝就医，以排除疾病的可能。
总之，如果宝宝只是偶尔摇头，且没有其他异常表现，家长可以先观察一下，调整宝宝的睡眠环境，保持宝宝头皮清洁。如果宝宝摇头的症状持续不缓解或伴有其他异常，应及时带宝宝就医，以便明确原因并进行相应的治疗。