办健康证一般会查艾滋病。健康证的办理一般在当地的疾病预防控制中心或经卫生行政部门审批承担预防性健康检查的医疗卫生机构进行，主要涉及的检查项目包括：
1.一般检查：包括身高、体重、血压、心肺听诊等。
2.内外科检查：皮肤、甲状腺、脊柱四肢、心肺听诊等。
3.实验室检查：血常规、尿常规、肝功能、肾功能、血糖、血脂、乙肝五项、艾滋病、梅毒等。
其中，艾滋病检查是健康证办理中的重要项目之一，主要是为了防止艾滋病的传播。艾滋病是一种严重的传染病，通过性传播、血液传播和母婴传播等方式传播。在一些特定的行业和场所，如食品行业、医疗行业等，艾滋病的检查是必要的，以保障公众的健康和安全。
需要注意的是，不同地区的健康证办理要求和检查项目可能会有所不同，具体情况可以咨询当地的疾病预防控制中心或相关医疗机构。同时，在进行健康证办理时，应如实告知医生自己的健康状况和病史，以便医生进行准确的检查和评估。