阴茎根部有时隐隐作痛可能与多种原因有关，以下是一些可能的原因和建议：
1.前列腺炎或前列腺增生：前列腺位于阴茎根部附近，炎症或增生可能导致疼痛。此外，还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。
治疗方法：如果怀疑是前列腺炎或前列腺增生，建议及时就医，进行相关检查（如前列腺液常规、超声等）。治疗方法包括药物治疗（如抗生素、α-受体阻滞剂等）、物理治疗（如前列腺按摩、热敷等）和生活方式调整（如避免久坐、戒烟限酒、规律性生活等）。
2.附睾炎或精索静脉曲张：附睾炎是附睾的炎症，精索静脉曲张则是精索内静脉的迂曲扩张。这两种情况都可能导致阴茎根部疼痛，并可能伴有阴囊下坠感、肿胀等症状。
治疗方法：附睾炎需要使用抗生素进行治疗，精索静脉曲张可能需要手术治疗。具体治疗方法应根据病情的严重程度而定。
3.阴茎硬结症：阴茎海绵体纤维化或硬结形成，可能导致阴茎勃起时疼痛，也可能在平时引起隐痛。
治疗方法：目前尚无特效的治疗方法，症状轻者可以通过局部热敷、理疗等缓解症状，严重者可能需要手术治疗。
4.其他原因：阴茎根部的疼痛还可能与外伤、感染、肿瘤等因素有关。
总之，阴茎根部有时隐隐作痛可能是多种疾病的表现，如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，应及时就医，进行详细的检查和诊断，以便采取针对性的治疗措施。同时，注意保持局部清洁卫生，避免久坐、长时间骑车等，有助于缓解症状。