补牙两周后牙疼的原因可能有以下几点：
1.补牙材料问题：如果补牙材料与牙齿不匹配，或者补牙材料中有气泡或裂缝，可能会导致牙齿再次感染或疼痛。
2.龋齿复发：补牙后，如果口腔卫生不佳，或者牙齿继续受到细菌侵蚀，可能会导致龋齿复发，引起牙疼。
3.牙齿损伤：补牙后，如果牙齿受到外力撞击或咬硬物，可能会导致牙齿损伤，引起牙疼。
4.牙龈问题：补牙后，如果牙龈发炎或萎缩，可能会导致牙齿根部暴露，引起牙疼。
5.其他问题：补牙后，如果出现牙根炎、牙髓病等其他口腔疾病，也可能会引起牙疼。
如果补牙两周后出现牙疼，建议及时就医，进行口腔检查和诊断。医生可能会根据具体情况采取相应的治疗措施，如重新补牙、根管治疗、拔牙等。同时，建议保持良好的口腔卫生，定期洗牙，避免咬硬物，以预防牙疼的发生。