精子活动率低的原因主要有以下几点：
1.精索静脉曲张：精索静脉曲张会导致睾丸局部温度升高，血管活性物质增加，从而影响精子活动率。
2.感染：附睾、输精管、精囊和前列腺等生殖道或生殖腺体的急慢性炎症都可降低精子的运动能力。
3.免疫因素：抗精子抗体可以从几个不同途径影响精子的受精功能。对精子的活力影响可能是抗精子抗体与精子的尾部结合，精子的活力受到妨碍，运动能力下降，穿透能力也变差。
4.内分泌因素：精浆中的泌乳素与精子活动呈线性关系，它可提高精子对氧的摄取，或通过cAMP系统影响精子活力，血清中雌激素水平升高时，降低精子的活力。精浆中睾酮过高可能抑制精子的运动。
5.染色体异常：常染色体和性染色体畸变除影响精子数目外，还影响到精子的成活率和前向运动能力。
6.其他因素：微量元素精浆中锌、铜、镁与精液质量有关，精浆中钙过高会降低精子活动率；阴囊温度过高，放射损伤，化学毒品及药物影响均可降低精子的活动能力。