耳垂内长硬疙瘩并伴有疼痛，可能是由以下原因引起的。
1.耳垂皮脂腺囊肿：这是一种常见的疾病，由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀所形成的潴留性囊肿。其发生与个人体质有关，可单发或多发，与耳垂内硬疙瘩相关的多为单发。囊肿生长缓慢，患者一般无自觉症状。若并发感染时，局部可出现红肿、疼痛，甚至可化脓溃破。
2.耳垂皮肤疖肿：这是由于细菌感染引起的皮肤急性化脓性炎症，好发于夏季，与高温、多汗、搔抓、卫生习惯不良等因素有关。初起时，局部出现红肿、疼痛的小硬结，逐渐肿大，呈锥形隆起。数日后，中央变软，有波动感，顶部出现黄白色点状脓头。破溃后，脓液排出，炎症逐渐消退而愈合。
3.耳垂瘢痕疙瘩：这是一种良性肿瘤，与耳垂内硬疙瘩相关的多由穿耳孔或外伤后所遗留的瘢痕疙瘩。其发生可能与个体瘢痕体质、耳垂部位的特殊性以及局部的长期刺激有关。皮损表现为隆起于皮肤表面的暗红色或紫红色斑块，质硬，表面光滑，界限清楚，可伴有疼痛和瘙痒。
4.其他原因：如耳垂内的脂肪瘤、表皮样囊肿、神经纤维瘤等，也可出现类似症状。
如果发现耳垂内长硬疙瘩并伴有疼痛，建议及时就医，医生会根据具体情况进行详细的检查和诊断，并给予相应的治疗。在就诊前，应注意保持局部清洁，避免搔抓和挤压，以免加重病情。