久咳不愈的原因可能是感染后咳嗽、咳嗽变异性哮喘、胃食管反流病、鼻后滴流综合征、嗜酸粒细胞性支气管炎、变应性咳嗽等。
1.感染后咳嗽：呼吸道感染本身急性期症状消失后，咳嗽仍然迁延不愈，多为刺激性干咳或咳少量白色黏液痰，通常持续3～8周，胸部X线片检查无异常。感染后咳嗽与感染导致的气道炎症后反应性增高有关。
2.咳嗽变异性哮喘：咳嗽是其唯一或主要临床表现，无明显喘息、气促等症状，但存在气道高反应性。主要表现为刺激性干咳，通常咳嗽比较剧烈，夜间咳嗽为其重要特征。感冒、冷空气、灰尘、油烟等容易诱发或加重咳嗽。
3.胃食管反流病：胃酸和其他胃内容物反流进入食管，导致以咳嗽为突出的临床表现，多发生在日间和直立位以及体位变换时，干咳或咳少量白色黏痰。
4.鼻后滴流综合征：鼻炎、鼻窦炎患者鼻后滴流刺激咳嗽感受器，导致以咳嗽为主要表现的综合征，可伴有鼻塞、流涕、打喷嚏等症状。
5.嗜酸粒细胞性支气管炎：气道嗜酸粒细胞浸润为特征的一种非哮喘性支气管炎，临床表现为慢性咳嗽，常是惟一的临床症状，干咳或咳少许黏痰，有时痰中可带血，多为白天咳嗽，少数伴有夜间咳嗽。
6.变应性咳嗽：具有气道高反应性特征的慢性咳嗽，多为刺激性干咳，通常咳嗽比较剧烈，夜间咳嗽为其重要特征。此外，还可能与接触冷空气、异味、运动或上呼吸道感染等有关。