一般来说，月经持续时间为2-8天，平均4-6天。因此，月经来三天就干净了可能是正常的，但也可能提示存在一些问题。以下是一些可能的原因：
1.正常变异：每个人的月经周期和持续时间都可能有所不同。有些女性的月经可能比较短，只要周期规律，出血量正常，也属于正常现象。
2.年龄因素：青春期和更年期的女性，由于卵巢功能尚未完全成熟或衰退，月经可能不太规律，持续时间也可能较短。
3.生活方式：生活习惯、饮食、运动、压力等因素也可能影响月经。例如，长期的压力、过度节食、剧烈运动等可能导致月经周期缩短或出血量减少。
4.疾病因素：某些疾病也可能导致月经异常，如子宫内膜异位症、子宫肌瘤、多囊卵巢综合征、甲状腺功能异常等。这些疾病可能会影响子宫内膜的生长和脱落，导致月经不规律。
5.药物影响：某些药物，如避孕药、抗生素、抗抑郁药等，可能会影响月经。如果正在服用这些药物，月经异常可能是药物的副作用之一。
如果月经持续时间突然变短或伴有其他异常症状，如经量过多或过少、痛经、周期不规律等，应及时就医。医生会进行详细的问诊和检查，以确定具体原因。如果是疾病引起的，需要及时治疗。
此外，保持健康的生活方式，如均衡饮食、适量运动、减少压力、规律作息等，有助于维持月经的正常。如果对月经情况有任何疑虑或担忧，应咨询医生的建议。