男性生殖器上长小水泡，可能是生殖器疱疹、包皮龟头炎、尖锐湿疣等疾病引起。以下是一些可能的原因和治疗方法：
1.生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒（HSV）感染引起，主要通过性接触传播。感染后，病毒会潜伏在神经节内，当免疫力下降时，病毒会被激活，导致生殖器部位出现水疱、溃疡等症状。治疗方法包括抗病毒药物（如阿昔洛韦、伐昔洛韦等）、局部止痛药物（如利多卡因凝胶等）和对症支持治疗。此外，保持局部清洁、避免搔抓和避免性接触也很重要。
2.包皮龟头炎：可由细菌、真菌感染或过敏等原因引起。常见症状包括龟头红肿、疼痛、瘙痒、水疱或糜烂等。治疗方法因病因而异，可能包括外用抗生素、抗真菌药物、抗过敏药物等，同时保持局部清洁。如果是包茎或包皮过长引起的，可能需要进行手术治疗。
3.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播。病变初期为单个或多个散在的淡红色小丘疹，质地柔软，顶端尖锐，后逐渐增大增多，可形成乳头状、菜花状或鸡冠状的赘生物。治疗方法包括物理治疗（如冷冻、激光、电灼等）、外用药物（如咪喹莫特乳膏等）和免疫调节剂等。此外，治疗期间应避免性生活，同时注意个人卫生。
4.其他原因：生殖器部位的其他疾病，如接触性皮炎、药疹等，也可能导致水疱的出现。治疗方法取决于具体病因，可能包括外用药物、口服药物或避免接触过敏原等。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因和治疗方法，具体情况可能因个体差异而有所不同。如果出现生殖器上长小水泡的症状，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以确定病因，并采取相应的治疗措施。同时，注意个人卫生，避免不洁性行为，有助于预防生殖器疾病的发生。