接种流脑疫苗后发烧40°C可能是疫苗的不良反应，也可能是其他原因引起的感染。以下是一些建议：
1.观察症状：注意观察孩子的精神状态、呼吸、心率等情况，以及是否出现皮疹、咳嗽、呕吐等其他不适症状。
2.物理降温：可以使用温水擦拭手心、腋窝、腹股沟等部位，或使用退热贴等方法帮助孩子降温。但要注意避免过度保暖，保持室内通风。
3.多喝水：鼓励孩子多喝水，以补充因发热导致的水分流失。
4.服用退烧药：如果孩子体温持续升高或出现明显不适，可以在医生的指导下服用退烧药，如布洛芬或对乙酰氨基酚。但要注意按照药品说明书的剂量使用，不要超量服用。
5.及时就医：如果孩子的体温持续不降、精神状态不佳或出现其他异常症状，应及时就医，以便明确病因并进行相应的治疗。
需要注意的是，接种流脑疫苗后少数孩子可能会出现发热等不良反应，但通常会在1-2天内自行缓解。如果孩子出现高热不退、精神萎靡、抽搐等异常情况，应及时就医，并告知医生孩子的接种史，以便医生进行准确的诊断和治疗。此外，在孩子接种疫苗后，应在接种单位观察30分钟，无异常后方可离开。回家后要注意孩子的护理，避免着凉、劳累，保持接种部位清洁干燥。