面瘫耳根疼的原因主要有以下几点：
1.病毒感染：面瘫是由于面神经受损引起的面部肌肉瘫痪，耳根疼可能是病毒感染导致面神经炎症，从而引起耳根疼痛。
2.神经受损：面瘫时面神经受损，可能会导致耳部感觉神经受损，引起耳根疼痛。
3.炎症反应：面瘫后，面部肌肉瘫痪，容易导致局部血液循环障碍，引起炎症反应，从而导致耳根疼痛。
4.其他原因：如中耳炎、耳带状疱疹等耳部疾病，也可能导致面瘫耳根疼。
需要注意的是，面瘫耳根疼可能是面瘫的并发症之一，也可能是其他耳部疾病引起的。如果出现面瘫耳根疼的症状，建议及时就医，进行相关检查，明确病因，以便进行针对性治疗。同时，面瘫患者在日常生活中应注意保暖，避免着凉，避免食用辛辣刺激性食物，保持心情愉悦，有助于面瘫的恢复。