孩子打完疫苗后反复发烧至39°C，可能是由以下原因引起的：
1.疫苗不良反应：部分孩子在接种疫苗后，可能会出现发热等不良反应，通常会在接种后24小时内出现，体温一般不会超过38.5°C，持续1-2天后可自行缓解。如果孩子的体温超过38.5°C，或发热持续时间较长，或伴有其他不适症状，如咳嗽、呕吐、腹泻等，应及时就医。
2.感染：接种疫苗后，孩子的免疫力可能会暂时下降，容易并发感染，如呼吸道感染、消化道感染等，从而引起发烧。如果孩子有咳嗽、流涕、咽痛、腹泻等症状，应及时就医，进行相关检查和治疗。
3.其他疾病：孩子本身患有其他疾病，如感冒、肺炎、手足口病等，接种疫苗后可能会使原有疾病加重，从而出现发烧症状。如果孩子有其他疾病的症状，应及时就医，明确诊断。
针对孩子打完疫苗后反复发烧至39°C的情况，家长可以采取以下措施：
1.物理降温：用温水擦拭孩子的颈部、腋窝、肘窝、腹股沟等部位，或使用退热贴，帮助孩子降温。
2.多喝水：让孩子多喝水，以补充因发热而流失的水分，防止脱水。
3.观察孩子的精神状态：如果孩子的精神状态良好，可以在家观察；如果孩子的精神状态较差，或出现高热惊厥等症状，应及时就医。
4.避免捂汗：不要给孩子穿过多的衣物或盖太厚的被子，以免影响散热。
5.及时就医：如果孩子的体温持续不降或升高，或伴有其他不适症状，应及时就医，在医生的指导下使用退烧药，如布洛芬、对乙酰氨基酚等。
需要注意的是，每个孩子的体质不同，对疫苗的反应也不同。如果孩子打完疫苗后出现反复发烧的情况，家长应密切观察孩子的情况，及时采取措施，如果症状持续不缓解或加重，应及时就医。同时，家长应注意保持孩子的个人卫生，勤洗手，避免带孩子去人员密集的场所，以预防感染。