小孩反复发烧39度，要重点关注病程，即发烧是在3天内还是5天以上。
一、如果是三天以内，常见的可能是幼儿急疹。幼儿急疹多发生于一岁以内的婴儿，会突然高热，但精神状态良好，使用退烧药后体温不能降到正常，很快又会烧到39度以上，持续约72个小时左右，然后热退疹出，病情结束。而且检查血常规基本正常。
二、若是长期发烧，体温达39度以上，且使用退烧药和抗生素效果均不佳，那就要留意是否存在其他疾病，比如川崎病、结核感染、传染性单核细胞增多症等，此时应该前往医院做进一步检查。
总之，对于小孩反复发烧39度的情况，要根据病程长短来判断可能的病症，以便采取相应的措施，若情况复杂或持续不好转，应及时就医深入检查。