女性小肚子两边隐隐作痛，可能与妇科疾病、内科疾病、外科疾病等有关。以下是可能的原因和建议：
1.妇科疾病：
盆腔炎：女性上生殖道及其周围组织的炎症，包括子宫、输卵管、卵巢、盆腔腹膜等部位发生炎症时，可引起小肚子两边疼痛，多为双侧性，同时还可能伴有白带异常、发热等症状。
宫颈炎：子宫颈发生炎症时，可出现下腹或腰骶部疼痛，并伴有白带增多、痛经等症状。
子宫内膜异位症：具有生长功能的子宫内膜组织出现在子宫腔被覆黏膜以外的其他部位时，可引起痛经、性交痛、月经失调等症状，疼痛可位于下腹、腰骶部及盆腔中部，有时还可放射到会阴部、肛门及大腿。
卵巢囊肿：卵巢囊肿蒂扭转、破裂或感染时，可出现下腹剧痛、恶心、呕吐等症状。
子宫肌瘤：子宫肌瘤较大时，可引起下腹坠胀、疼痛，尤其在性交、劳累后症状加重。
2.内科疾病：
肠炎：肠道炎症可引起下腹疼痛，同时还可能伴有腹泻、恶心、呕吐等症状。
肠痉挛：由于肠壁平滑肌强烈收缩而引起的阵发性腹痛，疼痛部位多在脐周，可伴有恶心、呕吐等症状。
3.外科疾病：
异位妊娠：受精卵在子宫体腔以外着床时，称为异位妊娠，其中以输卵管妊娠最为常见。异位妊娠可导致下腹剧痛，甚至发生休克。
输尿管结石：结石可引起肾绞痛，疼痛剧烈，多位于腰部或上腹部，并向同侧腹股沟、大腿内侧放射，同时还可能伴有血尿、恶心、呕吐等症状。
急性阑尾炎：阑尾发生炎症时，可出现转移性右下腹痛，即开始时疼痛在中上腹或脐周，数小时后腹痛转移并固定在右下腹。
如果出现小肚子两边隐隐作痛的症状，建议及时就医，进行相关检查，如B超、血常规、尿常规等，以明确病因，并进行针对性治疗。同时，在治疗期间应注意休息，避免劳累和剧烈运动，保持局部清洁卫生，避免感染。