女生两边小肚子隐隐作痛，可能与多种原因有关，以下是一些常见的情况：
1.排卵痛：在排卵期，卵巢可能会排出卵子，这可能导致一侧或双侧小肚子隐痛，通常还伴有阴道分泌物增多、基础体温升高等症状。
2.盆腔炎性疾病：如附件炎、盆腔炎等，可能导致小肚子两侧隐痛，还可能伴有白带异常、发热等症状。
3.子宫内膜异位症：子宫内膜异位到卵巢或盆腔其他部位，可能引起周期性的小肚子疼痛。
4.肠道问题：如肠痉挛、肠炎、肠梗阻等，也可能导致小肚子两侧疼痛，疼痛部位可能会发生变化，还可能伴有其他胃肠道症状，如腹泻、恶心、呕吐等。
5.泌尿系统问题：如膀胱炎、尿道炎、输尿管结石等，可能引起小肚子两侧疼痛，疼痛可能会放射到会阴部，还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。
6.其他：如异位妊娠、卵巢囊肿蒂扭转、疝气等，也可能导致小肚子两侧疼痛。
如果女生两边小肚子隐隐作痛持续时间较长、疼痛剧烈、伴有其他不适症状，或疼痛反复发作，建议及时就医，进行相关检查，如B超、血常规、尿常规等，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。
此外，需要注意的是，一些妇科疾病、肠道疾病等在某些情况下可能会影响生育能力，因此如果有生育需求，应及时就医，积极治疗。同时，女生在日常生活中应注意个人卫生，保持良好的生活习惯，避免过度劳累、着凉等。