大便后肛门疼痛的原因可能是肛裂、痔疮、肛周脓肿等，以下是具体分析及治疗方法：
1.肛裂：
病因：肛管皮肤全层纵行裂开后形成的感染性溃疡，多由便秘引起。
原理：肛裂导致的肛门疼痛，具有典型的周期性。即排便时肛裂裂口内神经末梢受刺激，引起肛管内烧灼样或刀割样疼痛，便后数分钟可缓解，称为疼痛间歇期；随后因肛门括约肌收缩痉挛，再次剧痛，此期可持续半到数小时，临床称为括约肌挛缩痛。
治疗方法：急性或初发的肛裂可用坐浴和润便的方法治疗；慢性肛裂可用坐浴、润便加扩肛的方法；经久不愈、保守治疗无效且症状较重的肛裂可采用手术治疗。
2.痔疮：
病因：痔是最常见的肛肠疾病，形成的原因主要有肛垫下移学说、静脉曲张学说等。
原理：内痔和混合痔可出现肛门疼痛，多由内痔嵌顿或混合痔的内痔部分受到挤压、牵拉引起。
治疗方法：无症状的痔通常不需要治疗；有症状的痔无需根治，遵循个体化的原则，旨在消除、减轻痔的主要症状，而非根治。
3.肛周脓肿：
病因：主要与肛腺感染有关，也与肛管损伤、局部感染等因素相关。
原理：肛门周围脓肿自行溃破或切开引流后，常形成肛瘘。如果感染反复发作，可导致肛瘘迁延不愈，给患者带来较大痛苦。
治疗方法：肛周脓肿一旦确诊，应及时手术切开引流，同时配合使用抗生素进行抗感染治疗。