来月经时发烧、头疼，可能是以下原因引起：
1.生理期身体免疫力下降，容易受到病原体感染，引发感冒、流感等上呼吸道感染，从而出现发烧、头疼症状。
2.生理期体内激素水平变化，可能会引起血管扩张或收缩，牵拉刺激血管痛觉末梢神经，进而引发头疼。
3.生理期盆腔充血可能会压迫腰骶部神经，引起下腹坠胀、疼痛，若疼痛放射至头部，也可能导致头疼。
4.部分女性在生理期可能会出现偏头痛，这是一种与卵巢周期变化有关的特殊类型的血管性头痛。
如果来月经时发烧、头疼，需要注意以下几点：
1.测量体温，观察体温变化。如果体温超过38.5℃，可以在医生的指导下服用退烧药，如布洛芬、对乙酰氨基酚等。
2.多喝水，补充水分，促进新陈代谢，有助于缓解发烧症状。
3.注意休息，避免过度劳累和剧烈运动。
4.保持心情愉悦，避免紧张、焦虑等不良情绪。
5.可以用热水袋或热毛巾热敷头部，缓解头疼症状。
6.如果发烧、头疼症状持续不缓解或加重，或出现其他不适症状，如恶心、呕吐、腹泻等，应及时就医，明确病因，进行针对性治疗。
此外，在生理期，女性应注意保暖，避免着凉，避免食用辛辣、刺激性食物，保持外阴清洁卫生。如果经常出现来月经时发烧、头疼的症状，建议及时就医，进行全面的检查，以排除其他潜在的疾病。