通输卵管时通常会有一定程度的疼痛，但疼痛程度因人而异。
输卵管通畅者疼痛较轻
若输卵管本身较为通畅，操作过程中阻力较小，患者可能仅感到轻度的坠胀不适，疼痛一般在可耐受范围内。
输卵管轻度粘连者疼痛稍明显
当输卵管存在轻度粘连时，通液或通气过程中需要一定的压力来分离粘连，此时患者会感觉疼痛相对明显些，但多数也在可接受范畴。
输卵管重度粘连或堵塞者疼痛较剧烈
若输卵管重度粘连或完全堵塞，操作时需要较大的压力才能使液体或气体通过，患者会感受到较为剧烈的疼痛，可能会比较痛苦。
不同个体对疼痛耐受不同
疼痛感受还与患者自身对疼痛的耐受程度有关。年轻、平时体质较好且对疼痛耐受较强的患者，可能觉得通输卵管时的疼痛相对没那么难以忍受；而体质较弱、对疼痛敏感的患者，可能会觉得疼痛更为明显。另外，紧张情绪也可能会放大疼痛的感受，所以在通输卵管前应尽量放松心情。