头疼低烧持续时间较长或反复发作，可能是疾病所致，需要引起重视，以下是一些可能的原因：
1.感染性疾病：如细菌、病毒、真菌等引起的呼吸道、消化道、尿路等感染，均可导致头疼低烧。这是由于病原体及其毒素作用于体内，释放炎症介质，引起发热和头疼。
2.中枢神经系统感染：脑炎、脑膜炎、脑脓肿等疾病，可直接刺激脑膜或颅内血管，引起头疼低烧。
3.自身免疫性疾病：如系统性红斑狼疮、类风湿关节炎等，可导致全身炎症反应，出现头疼、低烧等症状。
4.恶性肿瘤：某些恶性肿瘤，如白血病、淋巴瘤等，可因肿瘤细胞浸润、坏死或产生致热源，引起发热和头疼。
5.其他：如药物热、中暑、颅脑外伤、脑出血等，也可引起头疼低烧。
总之，头疼低烧的原因复杂多样，需要结合具体情况进行分析。如果持续时间较长或伴有其他症状，如恶心、呕吐、咳嗽、乏力等，应及时就医，进行相关检查，明确病因，以便采取针对性的治疗措施。