肩膀两侧长痘痘的原因及治疗方法如下：1.原因：痤疮丙酸杆菌感染：痤疮丙酸杆菌分解皮脂，产生游离脂肪酸，刺激毛囊导致炎症
马拉色菌感染：马拉色菌在痘痘丙酸杆菌的作用下，产生大量的双氢睾酮，刺激毛囊皮脂腺导管角质化，导致皮脂排泄障碍
内分泌失调：内分泌失调促使皮脂分泌过盛，无法排出而将毛囊阻塞
皮脂腺分泌过多：因压力、睡眠不足、疲劳、黄体素分泌过多等原因，而使皮脂分泌过多
毛囊角质化：毛囊角质化导致皮脂腺分泌受阻，使皮肤细胞无法正常代谢，造成毛囊堵塞，引发炎症
其他因素：遗传、饮食、药物、化妆品等因素也可能导致肩膀两侧长痘痘。2.治疗方法：外用药物：可使用维A酸乳膏、过氧化苯甲酰凝胶等药物，溶解粉刺，抑制痤疮丙酸杆菌
口服药物：口服抗生素，如四环素、红霉素等，可抑制痤疮丙酸杆菌和减少皮脂分泌
物理治疗：红蓝光照射、光动力疗法等物理治疗方法，可改善炎症
化学剥脱：对于较严重的痘痘，可采用化学剥脱术，促进皮肤修复
其他治疗：对于内分泌失调引起的痘痘，可采用激素疗法调节内分泌；对于毛囊角质化导致的痘痘，可使用维A酸类药物改善症状。
需要注意的是，治疗痘痘需要耐心和坚持，同时要注意皮肤清洁，避免挤压痘痘，以免引起感染和留下疤痕。如果痘痘症状严重或持续不愈，建议及时就医，寻求专业的治疗建议。