屎肠球菌和粪肠球菌的区别如下：
1.形态特性：屎肠球菌为革兰阳性球菌，直径0.5-1μm，单个、成双或短链排列。无芽胞，无荚膜。粪肠球菌略小于屎肠球菌，直径0.5-1.0μm，形态亦多样。
2.培养特性：屎肠球菌兼性厌氧，最适生长温度37℃，最适pH7.2-7.4。在血平板上形成较小、灰白色、不透明、表面光滑的菌落。在麦康凯琼脂平板上形成较大、粉红色、半透明的菌落。粪肠球菌兼性厌氧，最适生长温度37℃，最适pH7.4-7.6。在血平板上形成较大、灰白色、光滑、凸起的菌落。在麦康凯琼脂平板上形成中等大小、粉红色、半透明的菌落。
3.生化特性：屎肠球菌触酶阴性，不发酵D-甘露醇。粪肠球菌触酶阴性，发酵D-甘露醇。
4.致病性：屎肠球菌和粪肠球菌均可引起感染，屎肠球菌的耐药性较粪肠球菌更为严重。屎肠球菌感染可引起泌尿道感染、腹腔感染、败血症等。粪肠球菌感染可引起尿路感染、腹腔感染、心内膜炎等。
5.治疗药物：屎肠球菌和粪肠球菌对万古霉素、替考拉宁等药物敏感。对于屎肠球菌感染，可选用万古霉素、替考拉宁、利奈唑胺等药物治疗。对于粪肠球菌感染，可选用氨苄西林、头孢噻肟、左氧氟沙星等药物治疗。