甲硝唑和奥硝唑都是硝基咪唑类抗生素药物，都对厌氧菌有较强的抗菌作用，临床主要用于治疗厌氧菌引起的各种感染，也可用于预防和治疗手术后厌氧菌感染。两者的区别在于：
1.药物结构：甲硝唑是2-甲基-5-硝基咪唑-1-乙醇；奥硝唑是1-（2-羟乙基）-2-甲基-5-硝基咪唑。
2.抗菌谱：两者的抗菌谱相似，但奥硝唑的抗菌谱略广于甲硝唑。
3.药代动力学：奥硝唑的消除半衰期较长，血药浓度比甲硝唑高，因此作用时间更长。
4.适应症：两者的适应症相似，但奥硝唑主要用于治疗厌氧菌引起的感染，如腹膜炎、腹腔脓肿、败血症等；甲硝唑还可用于治疗滴虫病、阿米巴病等。
5.不良反应：两者的不良反应相似，但奥硝唑的不良反应发生率略低于甲硝唑。
6.用法用量：两者的用法用量相似，但奥硝唑的剂量略高于甲硝唑。
综上所述，奥硝唑的抗菌谱更广、作用时间更长、不良反应发生率更低，但价格也略高于甲硝唑。在临床应用中，医生会根据患者的具体情况选择合适的药物。