大母脚趾指甲根部疼可能由多种原因引起，以下是一些常见的情况：
1.甲沟炎：甲沟及其周围组织的感染，常由甲沟刺伤、嵌甲等引起。表现为甲沟部位的红肿、疼痛，严重时可能会化脓。
治疗：可在医生的指导下使用抗生素，如阿莫西林、头孢呋辛酯等；如果已经形成脓肿，可能需要切开引流。
2.外伤：脚趾受到挤压、碰撞等外伤，可能导致指甲根部受损，引起疼痛。
处理：在受伤后的24小时内冷敷，减少出血和肿胀；24小时后热敷，促进淤血吸收。如果疼痛严重，可以服用止痛药，如布洛芬。
3.指甲生长异常：指甲生长方向异常，可能会刺激甲沟组织，引起疼痛。
治疗：需要就医，由医生进行处理，可能需要修剪指甲或进行其他矫正治疗。
4.其他：痛风、类风湿性关节炎等疾病也可能导致脚趾疼痛。
如果大母脚趾指甲根部疼持续不缓解或加重，建议及时就医，明确原因，并进行相应的治疗。同时，要注意保持脚趾的清洁，避免穿过紧的鞋子，避免长时间站立或行走。