指甲上出现凹陷小坑，可能是以下原因引起：
1.银屑病：银屑病是一种慢性炎症性皮肤病，可导致指甲出现凹陷小坑、增厚、变色、畸形等症状。
2.扁平苔藓：扁平苔藓是一种皮肤黏膜慢性炎症性疾病，可累及指甲，导致指甲出现凹陷小坑、纵嵴、变色等症状。
3.斑秃：斑秃是一种自身免疫性疾病，可导致头发、眉毛、睫毛等毛发脱落，也可累及指甲，导致指甲出现凹陷小坑、纵嵴、变色等症状。
4.湿疹：湿疹是一种由多种内外因素引起的皮肤炎症反应，可导致皮肤出现红斑、丘疹、水疱、糜烂、渗出、结痂等症状，也可累及指甲，导致指甲出现凹陷小坑、增厚、变色、畸形等症状。
5.感染：某些细菌、真菌、病毒等感染也可导致指甲出现凹陷小坑、增厚、变色、畸形等症状。
6.药物副作用：某些药物如化疗药物、抗抑郁药物等可导致指甲出现凹陷小坑、变色、畸形等症状。
7.其他：营养不良、维生素缺乏、系统性疾病等也可导致指甲出现凹陷小坑。
治疗方法：
1.银屑病：可使用外用药物如糖皮质激素、维生素D3衍生物、角质促成剂等，系统药物如免疫抑制剂、生物制剂等进行治疗。
2.扁平苔藓：可使用外用药物如糖皮质激素、钙调神经磷酸酶抑制剂等，系统药物如免疫抑制剂、抗组胺药等进行治疗。
3.斑秃：可使用外用药物如米诺地尔酊，系统药物如糖皮质激素、免疫抑制剂等进行治疗。
4.湿疹：可使用外用药物如糖皮质激素、钙调神经磷酸酶抑制剂等，系统药物如抗组胺药、免疫调节剂等进行治疗。
5.感染：根据感染的类型选择合适的抗生素、抗真菌药物、抗病毒药物等进行治疗。
6.药物副作用：停药或调整药物剂量。
7.其他：补充营养、补充维生素等。
需要注意的是，指甲上出现凹陷小坑可能是多种疾病的表现，治疗方法也因病因而异。如果指甲凹陷小坑持续不消失或伴有其他症状，建议及时就医，明确诊断后进行针对性治疗。