一、泌尿系统疾病相关原因
1.肾小球源性血尿：如急性肾小球肾炎、慢性肾小球肾炎急性发作等肾脏疾病，炎症反应使肾小球滤过膜通透性改变，红细胞漏出进入尿液，导致尿液呈深褐色。这类疾病多与自身免疫反应或感染后免疫损伤相关，常见于中青年男性，起病前多有上呼吸道感染等前驱病史。
2.泌尿系统结石：肾结石、输尿管结石等泌尿系统结石在移动过程中可损伤尿路黏膜，引起黏膜出血，血液混入尿液使尿色变为深褐色。结石相关血尿通常伴有腰腹部疼痛，疼痛性质多为绞痛，疼痛可向会阴部放射，且疼痛程度较为剧烈。
3.泌尿系统感染：细菌等病原体感染泌尿系统，如膀胱炎、肾盂肾炎等，炎症刺激导致尿路黏膜充血、水肿、糜烂，进而引起出血，使尿液呈现深褐色。泌尿系统感染常伴有尿频、尿急、尿痛等尿路刺激症状，男性患者若存在前列腺增生等基础疾病时更易发生感染。
二、非泌尿系统疾病相关原因
1.药物或食物因素：某些药物可导致尿液颜色改变，如服用利福平后，药物经肾脏代谢可使尿液呈深褐色；大量食用甜菜等食物，其中含有的天然色素经代谢后也可能使尿液颜色加深。一般停用相关药物或调整饮食后，尿色可逐渐恢复正常。
2.横纹肌溶解症：剧烈运动、挤压伤、药物中毒等因素可导致横纹肌溶解，肌肉细胞破裂释放肌红蛋白进入血液，经肾脏滤过随尿液排出，使尿液呈深褐色。患者多有明确的诱因，如长时间高强度运动、肢体受到外力挤压等，同时可能伴有肌肉酸痛、无力等症状。
3.凝血功能障碍性疾病：如血友病等遗传性凝血因子缺乏疾病，或因肝病等导致凝血因子合成减少的获得性疾病，可引起全身多部位出血，当泌尿系统发生出血时，尿液可呈深褐色。这类患者往往有出血倾向的病史，如反复鼻出血、牙龈出血等。
三、特殊人群注意事项
老年男性：老年男性若出现尿色深褐，需尤其警惕泌尿系统肿瘤的可能，如膀胱癌、肾癌等，肿瘤组织生长过程中易发生坏死、出血，从而导致尿色改变。同时，老年男性常合并前列腺增生等疾病，也可能增加泌尿系统感染、结石等疾病的发生风险，需密切观察是否伴有排尿困难等症状。
有基础疾病男性：患有糖尿病的男性，若出现尿色深褐，需考虑糖尿病肾病等并发症的可能，糖尿病肾病可导致肾脏结构和功能受损，引起血尿等表现；患有高血压的男性，高血压性肾损害也可能引发类似尿色改变，需监测血压控制情况及肾功能指标。
有不良生活方式男性：长期大量饮酒、吸烟的男性，这些不良生活方式可损伤泌尿系统黏膜，降低机体抵抗力，增加泌尿系统疾病的发病几率，从而易出现尿色深褐情况，建议此类男性调整生活方式，戒烟限酒，保持健康的生活习惯。