对于6公分的巧克力囊肿，自愈的可能性较小。一般来说，巧克力囊肿的治疗方法包括药物治疗和手术治疗，具体治疗方法需要根据患者的年龄、症状、囊肿大小等因素来决定。以下是对每个部分的分析：
药物治疗：
适用情况：巧克力囊肿较小、症状较轻或无法耐受手术的患者。
治疗方法：使用药物抑制卵巢功能，减少囊肿的生长和出血。常用的药物包括避孕药、孕激素等。
注意事项：药物治疗需要长期使用，且可能会出现一些副作用，如乳房胀痛、体重增加、情绪波动等。患者需要在医生的指导下使用药物，并定期进行复查。
手术治疗：
适用情况：巧克力囊肿较大、症状明显或药物治疗无效的患者。
治疗方法：手术治疗包括腹腔镜手术和开腹手术两种。腹腔镜手术是一种微创手术，通过小孔插入器械进行手术，具有创伤小、恢复快等优点。开腹手术则是通过腹部切口进行手术，适用于囊肿较大或病情复杂的患者。
注意事项：手术治疗需要在全身麻醉下进行，术后需要注意休息和饮食，避免剧烈运动和性生活。患者需要在医生的指导下进行术后治疗，并定期进行复查。
总之，对于6公分的巧克力囊肿，建议及时就医，在医生的指导下选择合适的治疗方法。同时，患者需要注意休息和饮食，避免剧烈运动和性生活，保持心情愉悦，有助于病情的恢复。