一、生理性原因
（一）月经周期相关
女性在月经期间，子宫内膜前列腺素含量增高，可引起子宫平滑肌过强收缩、血管痉挛，造成子宫缺血、缺氧状态而出现小腹疼，这是较为常见的情况，一般月经来潮后疼痛会逐渐缓解，不同年龄女性月经期间激素水平变化有差异，青春期女性由于生殖系统发育尚不完善，月经期间小腹疼可能相对更常见，而育龄期女性可能因生活方式等因素影响疼痛程度；对于有规律性生活的育龄期女性，怀孕早期也可能出现类似月经前的小腹隐痛，这是因为受精卵着床时可能会对子宫产生一定刺激。
（二）排卵期
部分女性在排卵期会出现小腹疼痛，称排卵期腹痛，是由于卵泡破裂，卵泡液刺激腹膜引起，一般疼痛较轻微，持续时间较短，不同年龄女性排卵期身体状况略有不同，年轻女性内分泌相对活跃，排卵期症状可能相对明显些。
二、病理性原因
（一）妇科疾病
1.盆腔炎：多发生在性活跃的育龄女性，病原体感染子宫、输卵管、卵巢及周围组织等引起炎症，可表现为下腹部疼痛，疼痛可在活动或性交后加重，不同年龄女性发病风险有差异，性生活频繁的育龄期女性是高发人群，年龄较大女性如果有宫腔操作史等也可能患盆腔炎；盆腔炎还可能伴有阴道分泌物增多、异常阴道出血等症状。
2.子宫内膜异位症：子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位，常见症状为下腹痛和痛经，疼痛多随经期发作且进行性加重，年龄较大女性如果有长期月经不调等情况要警惕该病，育龄期女性是好发人群，子宫内膜异位症会影响生育等功能，对女性生殖健康有较大影响。
3.卵巢囊肿：卵巢囊肿扭转或破裂时可引起突发的小腹剧烈疼痛，育龄女性和围绝经期女性都可能患病，年轻女性卵巢囊肿可能与内分泌因素等有关，围绝经期女性卵巢功能衰退，囊肿性质可能发生变化，如卵巢囊肿扭转多见于中等大小、蒂较长的囊肿，体位改变等可能诱发。
4.子宫肌瘤：是女性生殖器最常见的良性肿瘤，黏膜下肌瘤可刺激子宫收缩，引起下腹坠胀、疼痛，还可导致月经改变，不同年龄女性患子宫肌瘤的概率不同，中年女性相对多见，肌瘤的大小、部位等会影响疼痛等症状表现。
（二）肠道疾病
1.肠炎：如急性肠炎，多与饮食不洁有关，可出现小腹疼痛，常伴有腹泻、恶心、呕吐等症状，不同年龄女性饮食卫生习惯不同，年轻女性可能因饮食不规律等易患肠炎，年龄较大女性如果有肠道基础疾病也可能反复出现肠炎相关症状，肠道炎症刺激肠道蠕动等会引起小腹疼痛不适。
2.肠梗阻：可导致小腹疼痛，同时伴有呕吐、停止排气排便等症状，任何年龄女性都可能发生肠梗阻，如育龄女性可能因术后肠粘连等原因引发肠梗阻，老年女性可能因肠道肿瘤等导致肠梗阻，肠道梗阻会影响肠道内容物的正常通过，进而引起一系列症状。
（三）泌尿系统疾病
1.膀胱炎：女性膀胱位置较浅，易受细菌感染，急性膀胱炎可出现小腹疼痛，伴有尿频、尿急、尿痛等症状，不同年龄女性尿道生理结构有差异，育龄期女性由于尿道短等因素相对易患膀胱炎，老年女性雌激素水平下降，尿道黏膜萎缩，也容易发生膀胱炎，细菌感染膀胱黏膜会引起炎症反应导致小腹疼痛。
2.输尿管结石：可引起小腹放射性疼痛，疼痛较为剧烈，常伴有血尿等症状，不同年龄女性患输尿管结石的原因有一定差异，年轻女性可能与代谢等因素有关，老年女性可能因尿路梗阻等因素诱发，结石在输尿管内移动会刺激输尿管平滑肌，引起痉挛性疼痛并放射至小腹部位。