硫酸氨基葡萄糖可能存在一些危害，比如胃肠道不适，部分人服用后可能出现恶心、呕吐、腹泻等症状；还可能引起过敏反应，表现为皮疹、瘙痒等；对于肝肾功能不全者，可能会加重肝肾功能负担。
胃肠道不适方面
一些患者服用硫酸氨基葡萄糖后会出现胃肠道反应，这是比较常见的危害表现。药物可能刺激胃肠道黏膜，影响正常的消化功能，导致恶心、呕吐等情况发生，尤其在空腹服用时可能更为明显。
过敏反应情况
个别人群对硫酸氨基葡萄糖过敏，服用后会引发过敏症状。皮肤可能出现皮疹，伴有瘙痒感，严重时可能出现呼吸困难等严重过敏表现，这与个体的过敏体质有关。
对肝肾功能影响
肝肾功能不全的患者在使用硫酸氨基葡萄糖时需谨慎，因为该药物需要通过肝肾代谢，可能加重肝肾的代谢负担，影响肝肾功能的正常运转，不利于这类患者的病情控制和身体恢复。
特殊人群需注意
对于孕妇和哺乳期女性，目前关于硫酸氨基葡萄糖对胎儿和婴儿的影响研究尚不充分，所以应避免随意使用；儿童由于身体各器官发育尚未成熟，硫酸氨基葡萄糖对儿童的安全性不确定，一般不建议儿童使用；老年人在使用时也需要密切关注自身身体反应，因为老年人的肝肾功能可能有所减退，更容易受到药物的影响。