硫酸氨基葡萄糖可能出现一些危害情况，比如胃肠道不适，部分人服用后可能出现恶心、呕吐、腹胀等症状；过敏反应，少数人会对其过敏，出现皮疹、瘙痒等；还可能影响肝肾功能，长期或大量使用可能对肝肾功能有一定影响，不过这种情况相对较少见；另外，对于孕妇和哺乳期女性，目前关于其安全性研究尚不充分，存在一定潜在风险。
胃肠道不适方面
部分患者服用硫酸氨基葡萄糖后会出现胃肠道反应，这是较为常见的危害表现之一，主要是药物对胃肠道黏膜有一定刺激作用，导致胃肠道功能紊乱，从而引发恶心、呕吐、腹胀等不适症状，一般在用药初期可能较为明显。
过敏反应情况
少数人可能对硫酸氨基葡萄糖过敏，过敏后身体会出现皮疹、瘙痒等表现，这是机体对药物的异常免疫反应，一旦出现过敏症状应立即停止用药，并采取相应的抗过敏治疗措施。
肝肾功能影响
长期或大量使用硫酸氨基葡萄糖时，可能会对肝肾功能产生一定影响，因为药物需要经过肝肾代谢，过量或长期使用可能加重肝肾的代谢负担，虽然这种情况相对少见，但仍需密切关注自身肝肾功能变化。
特殊人群风险
对于孕妇和哺乳期女性，由于目前关于硫酸氨基葡萄糖在这类特殊人群中的安全性研究不够充分，其对胎儿或婴儿可能存在潜在风险，所以这类人群使用时需要格外谨慎，在医生评估利弊后再决定是否使用。