清宫两周后小腹疼可能是以下原因导致：
1.术后感染：清宫术是一种有创的手术，术后可能会发生感染。如果小腹疼痛伴有发热、白带异常等症状，可能是术后感染引起的。建议及时就医，进行抗感染治疗。
2.宫腔残留：清宫术可能无法完全清除宫腔内的组织，如果有残留的组织，可能会导致小腹疼痛。需要进行B超检查，确定是否有残留，如果有残留，需要再次清宫。
3.子宫收缩：清宫术后，子宫会收缩，以排出宫腔内的组织和血液。子宫收缩可能会引起小腹疼痛，这是正常的生理现象。一般疼痛会逐渐减轻，如果疼痛持续加重或伴有大量出血，需要及时就医。
4.其他：清宫术后，子宫需要恢复到正常大小，可能会引起宫缩痛。此外，清宫术可能会引起子宫内膜异位症、盆腔炎等疾病，也会导致小腹疼痛。
如果清宫两周后小腹疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以便采取相应的治疗措施。同时，术后要注意休息，保持外阴清洁，避免性生活和盆浴，按照医生的要求进行复查。