巧克力囊肿会影响月经，具体表现如下：
1.月经周期缩短：月经周期缩短是巧克力囊肿的常见症状之一。这是由于巧克力囊肿会影响卵巢的正常功能，导致卵巢分泌的雌激素和孕激素水平失衡，从而影响月经周期。
2.月经量增多：巧克力囊肿还可能导致月经量增多。这是因为囊肿会导致子宫内膜增生，从而使月经量增多。
3.痛经：痛经是巧克力囊肿的另一个常见症状。这是因为囊肿会导致子宫收缩，从而引起痛经。
4.性交疼痛：巧克力囊肿还可能导致性交疼痛。这是因为囊肿会导致盆腔粘连，从而引起性交疼痛。
总之，巧克力囊肿会影响月经，导致月经周期缩短、月经量增多、痛经和性交疼痛等症状。如果出现这些症状，应及时就医，以便及时诊断和治疗。