治疗灰指甲并没有最好的药物，因为灰指甲的治疗效果因人而异，需要根据具体情况选择合适的药物。以下是一些常用的治疗灰指甲的药物：
1.外用药物：
阿莫罗芬搽剂：这是一种广谱抗真菌药物，能有效抑制灰指甲的病原菌。使用时，先将病甲锉薄，然后涂抹阿莫罗芬搽剂，每天1-2次。
环吡酮胺乳膏：对皮肤癣菌、酵母菌等有较强的抑制作用。用法为外用，将药膏涂于患处，每日1-2次。
碘酊：具有广谱抗真菌作用。先用小刀或指甲锉尽量去除病甲，然后用碘酊涂擦患处，每日1-2次。
2.口服药物：
伊曲康唑胶囊：是一种广谱抗真菌药物，适用于灰指甲较为严重或外用药物治疗无效的情况。服用方法为冲击疗法，即每个月服用一周，连续服用3-6个月。
特比萘芬片：也是一种广谱抗真菌药物，对皮肤癣菌有较强的抗菌活性。用法为口服，每日一次，连续服用6-12周。
3.手术治疗：
拔甲：适用于单发的灰指甲。在局部麻醉下，将病甲拔除。术后需要注意护理，避免感染。
病甲清除术：在局部麻醉下，将病甲削薄，然后用化学药物去除病甲。术后也需要注意护理。
需要注意的是，灰指甲的治疗需要一定的时间，一般需要几个月甚至更长时间。在治疗过程中，需要注意个人卫生，保持足部清洁干燥，避免与他人共用拖鞋、毛巾等物品，以防交叉感染。同时，还需要注意药物的副作用，如肝功能损害等。如果出现严重的不适或药物过敏等情况，应及时就医。此外，对于一些患有基础疾病的患者，如糖尿病、免疫系统疾病等，治疗灰指甲时需要更加谨慎，应在医生的指导下进行。