小便的时候阴囊有点疼，可能与以下原因有关：
1.睾丸炎或附睾炎：这是阴囊疼痛的常见原因之一。细菌或病毒感染可引起睾丸或附睾炎症，导致疼痛、肿胀和发热等症状。
2.精索静脉曲张：精索内的静脉回流受阻，导致精索蔓状静脉丛迂曲、伸长和扩张，阴囊内形成蚯蚓状的团块。患者可能会感到阴囊下坠、疼痛，久站或步行后症状更为明显。
3.前列腺炎：前列腺位于膀胱下方，与尿道相通。当前列腺发生炎症时，可能会导致排尿时疼痛，也可能会放射至阴囊部位。
4.尿道炎或膀胱炎：炎症刺激尿道和膀胱，也可能引起排尿时疼痛，有时疼痛可能会放射至阴囊。
5.其他原因：阴囊外伤、阴囊皮肤感染、睾丸扭转等也可能导致阴囊疼痛。
如果出现小便时阴囊疼痛的症状，建议及时就医，进行相关检查，如血常规、尿常规、超声等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。以下是一些可能的治疗方法：
1.药物治疗：根据病因和症状的严重程度，医生可能会开具抗生素、消炎药、止痛药等药物进行治疗。
2.物理治疗：如热敷、冷敷等，可以缓解疼痛和肿胀。
3.手术治疗：在某些情况下，如睾丸扭转等，可能需要手术治疗。
此外，在治疗期间，应注意休息，避免长时间站立或久坐，保持阴囊清洁干燥，避免穿过紧的内裤和裤子。同时，应注意个人卫生，多喝水，多排尿，有助于预防感染。如果疼痛持续不缓解或加重，应及时复诊。