支原体和衣原体感染的区别主要在于以下几个方面：
一、生物学特性
1.支原体：是一类没有细胞壁的原核细胞微生物，能通过滤菌器。
2.衣原体：是一种既不同于细菌也不同于病毒的一种微生物。
二、大小形态
1.支原体：大小为0.2-0.3μm，呈多形性，有球形、杆形、丝状等多种形态。
2.衣原体：原体直径为0.2-0.4μm，始体直径为0.5-1.0μm。
三、培养特性
1.支原体：营养要求较高，需要在含有血清、酵母浸膏和胆固醇等物质的培养基上生长。
2.衣原体：专性细胞内寄生，衣原体有独特的发育周期，即原体-始体-包涵体-原体。
四、所致疾病
1.支原体：肺炎支原体可引起呼吸道感染；脲原体、人形支原体可引起泌尿生殖道感染。
2.衣原体：沙眼衣原体可引起沙眼、包涵体结膜炎、泌尿生殖道感染、性病淋巴肉芽肿等疾病。
五、治疗方法
1.支原体：对四环素类、大环内酯类及氟喹诺酮类药物敏感。
2.衣原体：对四环素、红霉素、多西环素等药物敏感。
综上所述，支原体和衣原体感染在生物学特性、大小形态、培养特性、所致疾病和治疗方法等方面存在差异。