牙齿牙根发黑可能是以下原因导致的：
1.外源性色素沉着：长期吸烟、饮茶、喝咖啡或食用某些深色食物，可能导致色素沉着在牙齿表面或牙根部位。这些色素可以通过洗牙等方式去除。
2.龋齿：如果牙齿龋坏，细菌会分解牙齿中的有机物，产生黑色的物质。龋齿需要及时治疗，否则会进一步发展，影响牙齿健康。
3.牙髓坏死：牙髓是牙齿内部的组织，当牙髓受到感染或损伤时，会发生坏死。坏死的牙髓组织分解产生的物质会使牙齿变黑。这种情况通常需要进行根管治疗。
4.四环素牙：在牙齿发育期间，服用了四环素类药物，药物会与牙齿中的钙结合，形成黄色至棕褐色的复合物，导致牙齿变色。四环素牙一般无法通过常规方法美白。
5.牙外伤：牙齿受到外伤，可能导致牙髓出血、坏死，进而使牙根部位变黑。
6.年龄增长：随着年龄的增长，牙齿可能会出现自然的老化和变色。
7.其他原因：某些系统性疾病（如铅中毒）或药物副作用也可能导致牙齿变黑。
如果发现牙齿牙根发黑，建议及时就医，医生会根据具体情况进行详细的口腔检查和诊断，并制定相应的治疗方案。早期治疗可以避免问题进一步加重，保护牙齿的健康。同时，保持良好的口腔卫生习惯，定期洗牙和检查，有助于预防牙齿问题的发生。