引起耳根子疼的原因有很多，常见的原因包括：
1.感染：如外耳道炎、中耳炎等，炎症可导致耳部疼痛，并可放射至耳根。
2.外伤：耳部受到直接或间接的外力撞击、挤压等，可引起耳根疼痛。
3.神经痛：三叉神经痛、舌咽神经痛等可表现为耳部放射性疼痛。
4.颞下颌关节紊乱：可导致咀嚼时耳部疼痛，也可伴有耳根疼痛。
5.其他：颈椎病、心血管疾病等也可能引起耳根子疼。
此外，长期佩戴耳机、睡眠姿势不当、过度劳累、精神紧张等也可能导致耳根子疼。
如果出现耳根子疼，建议及时就医，明确原因，以便进行针对性治疗。同时，要注意保持耳部清洁，避免长时间佩戴耳机，避免耳部受到外力撞击，保持良好的生活习惯和心态。