引起耳根疼的原因较多，常见的有以下几种：
1.耳部疾病：如外耳道炎、中耳炎等，炎症可导致耳部疼痛，并可放射至耳根。此外，耳部的耵聍栓塞、外耳道疖肿等也可引起耳根疼。
2.感染：上呼吸道感染、扁桃体炎等感染性疾病可导致耳部牵涉痛，从而引起耳根疼。
3.神经痛：三叉神经痛、舌咽神经痛等神经痛可表现为耳部放射性疼痛。
4.外伤：耳部受到外力撞击、挤压等损伤，可导致耳根疼。
5.其他：颈椎病、颞下颌关节紊乱等也可能引起耳根疼。
此外，一些全身性疾病，如糖尿病、心脏病等也可能导致耳根疼。
如果出现耳根疼，建议及时就医，进行详细的耳部检查、血常规等检查，以明确病因，并进行针对性治疗。同时，要注意保持耳部清洁，避免挖耳等不良习惯。