肛门两边疼的原因有很多，以下是一些常见的病因：
1.肛裂：
病因：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡。
原理：肛管皮肤较硬，排便时肛管受干结粪便的扩张和刺激，导致肛管裂开，进而引起感染。
治疗：急性肛裂以保守治疗为主，陈旧性肛裂需手术治疗。
2.肛窦炎：
病因：肛窦开口向上，易积存粪便引起感染，导致肛窦炎。
原理：肛窦炎常并发肛乳头炎，使乳头肥大。排便时，粪便可擦伤乳头，引起乳头炎，继而引发肛门两边疼。
治疗：可采用坐浴、局部使用抗生素栓剂等方法治疗。
3.肛周脓肿：
病因：肛腺阻塞感染，形成肛周脓肿。
原理：脓肿破溃后，脓液排出，疼痛可暂时缓解，形成肛瘘后，疼痛又会出现。
治疗：肛周脓肿一旦确诊，应及时切开引流。
4.血栓性外痔：
病因：肛门缘静脉破裂，血液外渗到结缔组织内，形成血栓，在肛门部皮下形成圆形或椭圆形肿块。
原理：肿块体积不大，呈暗紫色，边界清楚，质硬，触痛明显。
治疗：血栓性外痔经保守治疗无效时，应手术取出血栓。
5.肛管直肠癌：
病因：肛管直肠癌破溃感染，或肛管皮肤擦伤、直肠药物注射、局部放疗后，均可导致肛门两边疼。
原理：肛管直肠癌导致的肛门两边疼为持续性，并逐渐加重。
治疗：肛管直肠癌确诊后，应尽早手术治疗。
肛门两边疼可能还有其他原因，如肛门湿疹、肛瘘等。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。