新生儿益生菌没有固定的最佳食用时间，一般建议在喂奶后30分钟左右服用。
服用益生菌的原因/作用：益生菌是有益的活性微生物，可以帮助维持肠道菌群平衡，促进营养吸收，提高免疫力。新生儿的肠道菌群尚未完全建立，容易受到外界因素的影响，如抗生素的使用、饮食改变等，可能会导致肠道菌群失衡。补充益生菌可以帮助调节肠道菌群，增强肠道功能。
需要注意的是，益生菌不是药物，不能替代药物治疗疾病。如果新生儿有任何健康问题，应及时就医，遵循医生的建议进行治疗。同时，益生菌也不是越多越好，应按照产品说明或医生的建议使用。此外，在食用益生菌时，还需注意以下几点：
1.选择适合新生儿的益生菌产品，最好是专门为婴儿设计的益生菌制剂。
2.注意益生菌的保存方式，一般需要冷藏保存，按照说明正确保存。
3.与抗生素同时使用时，应间隔一定时间，以免影响益生菌的效果。
4.如果新生儿对益生菌过敏，应避免使用。
总之，益生菌对新生儿的健康有益，但使用时应谨慎，遵循医生的建议。如果对新生儿的饮食和健康有任何疑问，建议咨询医生或专业的营养师。