杞菊地黄丸和知柏地黄丸都是滋肾养肝的中成药，都可用于肝肾阴亏，眩晕耳鸣，羞明畏光，迎风流泪，视物昏花等病症，但两药的药物组成、功效主治和不良反应都有所不同。
杞菊地黄丸是在六味地黄丸的基础上加入枸杞子和菊花而成。方中重用熟地黄滋阴补肾，填精益髓，为君药。山茱萸补养肝肾，并能涩精；山药补脾益肾，固精止遗，共为臣药。泽泻利湿泄浊，并能减熟地黄之滋腻；茯苓健脾渗湿；丹皮清泄相火，并制山茱萸之温涩。三药为佐药。枸杞子滋补肝肾，益精明目；菊花清肝明目，平抑肝阳。两药既能养肝明目，又能清热降火，共为使药。诸药配合，共奏滋肾养肝之功。
知柏地黄丸则是在六味地黄丸的基础上加入知母和黄柏而成。知母清热泻火，滋阴润燥；黄柏清热燥湿，泻火除蒸，解毒疗疮。两药相须为用，增强滋阴降火之效。
因此，知柏地黄丸的滋阴降火之力比杞菊地黄丸更强，适用于阴虚火旺，潮热盗汗，口干咽痛，耳鸣遗精，小便短赤等症。杞菊地黄丸则更偏于养肝明目，适用于肝肾阴虚，伴有头晕目眩，视力减退，腰膝酸软，遗精等症。