自身免疫性脑炎治愈后可能会留下一些后遗症，具体包括：
1.认知障碍：患者可能会出现记忆力下降、注意力不集中、语言理解和表达困难等认知障碍。
2.精神症状：如抑郁、焦虑、幻觉、妄想等精神症状。
3.运动障碍：可能会出现共济失调、震颤、肌肉无力等运动障碍。
4.自主神经功能障碍：如多汗、心悸、血压波动等自主神经功能障碍。
5.睡眠障碍：可能会出现失眠、嗜睡、噩梦等睡眠障碍。
6.其他：如头痛、头晕、感觉异常等。
需要注意的是，这些后遗症的严重程度和类型因人而异，有些患者可能会完全恢复，而有些患者可能会留下不同程度的残疾。如果出现上述症状，建议及时就医，进行评估和治疗。此外，患者在治疗期间和康复期间需要注意休息、保持良好的生活习惯、进行适当的康复训练等，以促进恢复。