三个月宝宝消化不良，可能由生理因素或疾病因素引起。可采取以下方法缓解：
1.调整饮食：母乳喂养的宝宝，继续母乳喂养；人工喂养的宝宝，可将牛奶适当冲淡，同时还应暂停辅食添加。
2.腹部按摩：以宝宝的肚脐为中心，用手掌顺时针按摩宝宝的腹部，每天按摩数次，有助于缓解消化不良的症状。
3.补充益生菌：益生菌可以帮助宝宝调节肠道菌群，改善消化不良的症状。可在医生的指导下，给宝宝补充益生菌。
4.药物治疗：如果宝宝消化不良的症状较为严重，可在医生的指导下，使用一些药物进行治疗，如胃蛋白酶合剂、多酶片等。
需要注意的是，三个月的宝宝消化系统尚未发育完全，容易出现消化不良的情况。如果宝宝的消化不良症状持续时间较长或伴有其他症状，如腹泻、呕吐、发热等，应及时就医，以排除其他疾病的可能。